Traitement de données moléculaires :: Rastop

  Ressource logicielle

   Téléchargement

   Installation

  • Extraire le contenu du fichier compacté (“archive”) “.zip” qui vient d’être téléchargée [rastop203vf+help.zip] : clic droit sur le fichier, et sélectionner “extraire ici”.
  • Au besoin télécharger et installer au préalable un logiciel d’extraction de fichiers compactés (“archives) comme 7zip

   Utilisation du logiciel

  • Ouvrir le dossier (répertoire) “rastop203vf+help”
  • ouvrir le sous-dossier (répertoire) “rastopvf”
  • double-cliquer sur “rastop.exe”
  • En cas de message d’erreur (“Dll manquantes”) :
    • télécharger le fichier “rastop-dll.zip
    • Extraire le contenu du fichier compacté (“archive”) “.zip” qui vient d’être téléchargée [rastop-dll.zip] : clic droit sur le fichier, et sélectionner “extraire ici”.
    • Au besoin télécharger et installer au préalable un logiciel d’extraction de fichiers compactés (“archives) comme 7zip
    • ouvrir le dossier (répertoire) “rastop-dll” qui vient d’être créé
    • sélectionner et copier les trois fichiers : MFC42.DLL, MFC42D.DLL et MSVCRTD.DLL
    • les coller dans le dossier (répertoire) “windows/system” ou “WINNT/system32”

    Fiche technique (officielle, épreuve “pratique” du bac)

 Fichiers de données moléculaires

 Tutoriel

  • Comment savoir si une molécule comporte des atomes de C, H et N ? [lire video]

D.4.3 – Les molécules de la matière vivante Exercice 3

Compétence à développer : Pratiquer un raisonnement scientifique – Exploiter des informations obtenues à partir d’une application de visualisation de modèles moléculaires (Rastop).

Problème général à résoudre :
Qu’est-ce qui caractérise la matière vivante ?
Qu’est-ce qui la distingue de la matière inerte ?

Hypothèse – La matière vivante est constituée de molécules qui lui sont propres.

Ce que l’on sait :

  • la matière inerte et la matière vivante sont des mélanges hétérogènes de molécules.
  • il existe deux catégories de molécules : les molécules minérales et les molécules organiques ;
  • la proportion de H, C et N est plus importante dans la matière vivante que dans la matière inerte.
Questionnement :

  • La matière inerte et la matière vivante sont-elles constituées de molécules minérales ET de molécules organiques ?
  • Si oui, existe-t-il une différence de proportions ?
  • Si non, quelle catégorie de molécules est propre à la matière inerte ? Propre à la matière vivante ?

Protocole :

  1. Recherche d’informations.
    Pour chacun des exemples de molécules qui suivent, consulter une visualisation d’un modèle moléculaire à l’aide du logiciel Rastop (1).
    Noter les éléments chimiques présents.

    1. Molécules de la matière inerte
      1. ammoniac
      2. olivine
    2. Molécules de la matière vivante
      1. oléine (acide oléique)
      2. méthionine
    3. Molécules minérales
      1. quartz
      2. albite
    4. Molécules organiques
      1. glucose
      2. chlorophylle
  2. Caractéristiques d’une molécule organique.
    Comparer les éléments chimiques entrant dans la constitution des molécules organiques et des molécules minérales : quels sont ceux que l’on trouve “ensemble” toujours dans une molécule organique ?
  3. Constitution de la matière vivante.
    1. Indiquer à quelle(s) catégorie de molécules appartiennent les deux exemples de molécules de la matière inerte.
    2. Indiquer à quelle(s) catégorie de molécules appartiennent les deux exemples de molécules de la matière vivante.
    3. BILAN : compléter le tableau qui suit.
matière inerte matière vivante
molécule minérale
molécule organique

 

D.4.2 – Les molécules de la matière vivante Exercice 2

Compétence à développer : Pratiquer un raisonnement scientifique – Exploiter des informations obtenues à partir d’une application de visualisation de modèles moléculaires (en ligne)

Problème général à résoudre :
Qu’est-ce qui caractérise la matière vivante ?
Qu’est-ce qui la distingue de la matière inerte ?

Hypothèse – La matière vivante est constituée de molécules qui lui sont propres.

Ce que l’on sait :

  • la matière inerte et la matière vivante sont des mélanges hétérogènes de molécules.
  • il existe deux catégories de molécules : les molécules minérales et les molécules organiques ;
  • la proportion de H, C et N est plus importante dans la matière vivante que dans la matière inerte.
Questionnement :

  • La matière inerte et la matière vivante sont-elles constituées de molécules minérales ET de molécules organiques ?
  • Si oui, existe-t-il une différence de proportions ?
  • Si non, quelle catégorie de molécules est propre à la matière inerte ? Propre à la matière vivante ?

Protocole :

  1. Recherche d’informations
    Pour chacun des exemples de molécules qui suivent, effectuer une recherche sur l’internet de la formule brute de la molécule.
    Noter cette formule brute.

    1. Molécules de la matière inerte
      1. ammoniac
      2. olivine
    2. Molécules de la matière vivante
      1. chlorure de sodium
      2. méthionine
    3. molécules minérales
      1. quartz
      2. albite
    4. molécules organiques
      1. glucose
      2. chlorophylle
  2. Définition d’un molécule organique.
    Comparer les éléments chimiques entrant dans la constitution des molécules organiques et des molécules minérales : quels sont ceux que l’on trouve “ensemble” toujours dans une molécule organique ?
  3. Constitution de la matière inerte et de la matière vivante.
    1. Indiquer à quelle(s) catégorie de molécules appartiennent les deux exemples de molécules de la matière inerte.
    2. Indiquer à quelle(s) catégorie de molécules appartiennent les deux exemples de molécules de la matière vivante.
    3. BILAN : compléter le tableau qui suit.
matière inerte matière vivante
molécule minérale
molécule organique

 

D.4.1 – Les molécules de la matière vivante Exercice 1

Compétence à développer : Pratiquer un raisonnement scientifique – Exploiter des informations obtenues par recherche sur l’internet.

Problème général à résoudre :
Qu’est-ce qui caractérise la matière vivante ?
Qu’est-ce qui la distingue de la matière inerte ?

Hypothèse – La matière vivante est constituée de molécules qui lui sont propres.

Ce que l’on sait :

  • la matière inerte et la matière vivante sont des mélanges hétérogènes de molécules.
  • il existe deux catégories de molécules : les molécules minérales et les molécules organiques ;
  • la proportion de H, C et N est plus importante dans la matière vivante que dans la matière inerte.
Questionnement :

  • La matière inerte et la matière vivante sont-elles constituées de molécules minérales ET de molécules organiques ?
  • Si oui, existe-t-il une différence de proportions ?
  • Si non, quelle catégorie de molécules est propre à la matière inerte ? Propre à la matière vivante ?

Protocole :

  1. Recherche d’informations
    Pour chacun des exemples de molécules qui suivent, effectuer une recherche sur l’internet de la formule brute de la molécule.
    Noter cette formule brute.

    1. Molécules de la matière inerte
      1. ammoniac
      2. olivine
    2. Molécules de la matière vivante
      1. chlorure de sodium
      2. méthionine
    3. molécules minérales
      1. quartz
      2. albite
    4. molécules organiques
      1. glucose
      2. chlorophylle
  2. Définition d’un molécule organique.
    Comparer les éléments chimiques entrant dans la constitution des molécules organiques et des molécules minérales : quels sont ceux que l’on trouve “ensemble” toujours dans une molécule organique ?
  3. Constitution de la matière inerte et de la matière vivante.
    1. Indiquer à quelle(s) catégorie de molécules appartiennent les deux exemples de molécules de la matière inerte.
    2. Indiquer à quelle(s) catégorie de molécules appartiennent les deux exemples de molécules de la matière vivante.
    3. BILAN : compléter le tableau qui suit.
matière inerte matière vivante
molécule minérale
molécule organique

Corrigé

  1. Molécules de la matière inerte
    1. ammoniac NH3
    2. olivine (Mg,Fe)2[SiO4]
  2. Molécules de la matière vivante
    1. chlorure de sodium NaCl
    2. méthionine C5H11NO2S
  3. molécules minérales
    1. quartz SiO2
    2. albite NaAlSi3O8
  4. molécules organiques
    1. glucose C6H12O6
    2. chlorophylle C55H72O5N4Mg

Formule développée d’une molécule organique (Glucose : C6H12O6)

glucoses

 
matière inerte matière vivante
molécule minérale  OUI OUI
molécule organique  NON  OUI